تشخیص و ردیابی ژنهای موثر در بیماری‌زایی جدایه های pseudomonas syringae pv. syringae از میزبان‌های مختلف
پایان نامه
- وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شیراز - دانشکده کشاورزی
- نویسنده رسول رضائی
- استاد راهنما سید محسن تقوی علی نیازی
- سال انتشار 1392
چکیده
طی فصول مختلف سالهای 1391-1389، از گیاهان مختلفی نظیر هستهداران، دانهداران و غلات در استان‌های کهگیلویه و بویراحمد، کردستان، فارس و چهارمهال و بختیاری سی سویه pseudomonas syringae pv. syringae جداسازی گردید. شش سویه برای مطالعات بعدی مورد استفاده قرار گرفتند. برای بررسی نوسانات جمعیتی سویههای مختلف pss، هر سویه به تمام گیاهان مورد مطالعه مایهزنی شد. در برگ‌های هلو سویههای s18،a10 و p5 به خوبی رشد کردند و در برگ‌های گیلاس بیشترین رشد مربوط به جدایه‌های گیلاس و هلو بود. همچنین در برگ‌های زردآلو سویههای a10، s18 و p5 به خوبی رشد کردند. در نهال گلابی تنها جدایهای که به خوبی رشد کرد جدایه گلابی بود. در آزمون بیماری‌زایی و بررسی پرآزاری، شش جدایه pss از میزبان‌های مختلف مورد استفاده قرار گرفت. تمام جدایه‌ها با شدتهای متفاوت توانایی ایجاد علائم بیماری را در نهالهای هلو داشتند. در ساقه زردآلو سه سویه a10 ، p5 و s18 علائم نکروز پیشرفته را ایجاد کردند. تنها سویهای که توانست علائم بیماری را در برگ‌های گلابی ایجاد نماید سویه p8 بود. در برگ‌های گندم علائم شدید به صورت لکههای آبسوخته و توسط سویه w3 ایجاد گردید. مهمترین ژنهای بیماری‌زایی با استفاده از آغازگرهای اختصاصی در جدایه‌های مختلف ردیابی شد. ژن مسئول تولید زهرابه سیرینگومایسین (syrb) در تمام سویههای pss مورد مطالعه و ژن مسئول ترشح زهرابه سیرینگومایسین (syrd) در جدایه‌های p5، s18، w3 و a10 ردیابی شد. ژن sypa مسئول تولید زهرابه سیرینگوپپتین، در جدایه‌های p5، s18، p8 و a20 و ژن sypb در جدایه‌های p5، s18، w3 و a10 ردیابی گردید. در جدایه‌های p5 و s18 ژن nit مسئول تولید آنزیم نیتریلاز، ردیابی و ژن تولید کننده سیدروفور اکروموباکتین (ach) فقط در سویه p5 ردیابی گردید. سویه w3 در آزمون تشخیصی pcr با استفاده از جفت آغازگر اختصاصی hrma1 و hrma2، یک قطعه dna با اندازه تقریبی 1128 جفت باز را تولید کرد. قطعههای تکثیر شده با آغازگرهای اختصاصیb1، b2 (ژن syrb) و d2 ,d1 (ژن syrd) به ترتیب با اندازه های750 و 446 جفت باز تعیین ترادف شدند. قطعات تعیین ترادف شده با قطعات مورد نظر در جدایه‌های مختلف pss موجود در بانک ژن شباهت داشتند. میزان بیان ژن pad3 که در تولید فیتوالکسین کامالکسین در گیاه آرابیدوپسیس نقش دارد، بر اساس واکنش real time pcr مورد بررسی قرار گرفت. الگوی بیان گیاه آرابیدوپسیس نشان داد که گیاه در برابر سویههای مختلف pss مقادیر متفاوتی از ژنهای دفاعی را فعال میکند.
منابع مشابه
مقایسه خصوصیات ژنوتیپی سویه های Pseudomonas syringae pv. syringae از میزبان های مختلف با استفاده از rep-PCR
Pseudomonas syringae pv. syringae (Pss) با دارا بودن بیش از 180 میزبان، بعنوان یکی از مهمترین بیمارگرهای گیاهی تلقی شده و سالیانه خسارات قابل توجهی را در سراسر دنیا به محصولات مختلف وارد می کند. به منظور بررسی خصوصیات ژنوتیپی باکتری مذکور، 58 جدایه از میزبان های مختلف شامل هسته داران، غلات، دانه داران، برخی علف های هرز و گیاهان زینتی در استان های فارس، کهگیلویه و بویراحمد، چهارمحال و بختیاری ...
متن کاملCharacterization of alginate lyase from Pseudomonas syringae pv. syringae.
The gene encoding alginate lyase (algL) in Pseudomonas syringae pv. syringae was cloned, sequenced, and overexpressed in Escherichia coli. Alginate lyase activity was optimal when the pH was 7.0 and when assays were conducted at 42 degrees C in the presence of 0.2 M NaCl. In substrate specificity studies, AlgL from P. syringae showed a preference for deacetylated polymannuronic acid. Sequence a...
متن کاملRegulation of alginate biosynthesis in Pseudomonas syringae pv. syringae.
Both Pseudomonas aeruginosa and the phytopathogen P. syringae produce the exopolysaccharide alginate. However, the environmental signals that trigger alginate gene expression in P. syringae are different from those in P. aeruginosa with copper being a major signal in P. syringae. In P. aeruginosa, the alternate sigma factor encoded by algT (sigma22) and the response regulator AlgR1 are required...
متن کاملبیماری لکه‌زاویه‌ای ختمی خواب‌آلود ناشی از یک پاتووار مشابه با Pseudomonas syringae pv. syringae *
بیماری لکه‌زاویه‌ای ختمی خواب‌آلود (Malvaviscus pendulifloru)در چند سال متوالی در برخی از مناطق استان‌های مازندران و گلستان مشاهده شده است. لکه‌ها به قطر 3 تا 4 میلی‌متر، نکروزه، قهوه‌ای رنگ، زاویه‌ای شکل و بدون هاله بودند. از برگ‌های بیمار، یک سودوموناس اکسیداز منفی و تولید کننده لوان جداسازی گردید. جدایه‌ها در ویژگی‌های فنوتیپی ، نوع و میزان اسیدهای چرب سلولی و توالی ناحیه ITS شبیه ب...
متن کاملمقایسه جدایه‌های Pseudomonas syringae pv. Syringae van Hall از میزبان‌های مختلف ازنظر ویژگی‌های فنوتیپی، سرولوژیک و بیماری‌زایی
In order to compare Pseudomonas syringae pv. syringae (Pss) isolates from cereals, citrus, stone fruits and weeds by phenotypic characteristics, serological properties and pathogenicity, samples were taken during 1998-1999 in Fars Province, Karaj, Fereidan, Aligudarz and Shahrekord regions. From 350 fluorescent isolates, 47 were negative with respect to oxidase, potato soft rot and arginine dih...
متن کاملPseudomonas syringae pv. tabaci in papaya seedlings
The natural occurrence of Pseudomonas syringae pv. tabaci causing leaf spot symptoms in papaya seedlings is reported. The pathogen was identified through biochemical, physiological, serological, and molecular assays and artificial inoculations in papaya plants. It was also shown that the strains were pathogenic to bean and tobacco plants. The restriction patterns obtained with Afa I, Alu I, Dde...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
نوع سند: پایان نامه
وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شیراز - دانشکده کشاورزی
کلمات کلیدی
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023